mapxtreme在vs里怎么用_mapxtreme_mapxtreme最新版(15)

CHIME 2.6

IE与NetScape浏览器插件,安装后,可以直接用浏览器观看PDB式的文件,直接在浏览器中观看3D分子。

ICMLite

维分子浏览工具，是MolSoft公司出品的软件ICM的简化版,免费推出， 但功能十分强大。可读取PDB式及其他数种式的分子文件,易于操作,显示的分子图像我认为优于RasMol,得一试。还可以进行一些计算操作。

POV-Ray 3.5

是一个高质量、完全免费创造最棒三维图像的非常有名的工具，用在分子生物学上，便是用它生成高质量的三维大分子图像。见过Science封面上漂亮极的分子图像吗？便是用它与以下软件结合制作出来的。运算POV式文件，生成三维图形，非常棒。该软件相当于一种语言，修改pov式文件，可以定义光源、摄像机、材质、阴影等因素，把生物分子的表面用材质填充，根据光源、摄像机得到分子三维图的一个角度的图。分辨率最大可达1280*1024。图象质量精美。

DS viewer pro 5.0

Accerlys公司Discovery studio系列中的一员。

3D-mol viewer,

带动windows系统下生物软件革新的vector NTIsuite中的一员。

Cn3D

是由NCBI开发的用于观看蛋白质三维结构的软件，其设计的主要目的是为NCBI在其站点中的蛋白质结构MMDB提供的结构观察软件，其主要的操作界面分为两个窗口，如右图所示，一个为结构窗口，另一个为序列窗口。与其他的类的软件，如Rasmol，Weblabview等相比，其在结构观察方面主要功能上基本相，但是图形式上比Rasmol和Weblabview要差一些。而在与网络连接上，该软件能依托NCBI所建立的所建立的MMDB结构，能直接根据输入的序列号从中利用其内嵌的Entrez搜索引擎调出蛋白结构来进行观察，比其他软件要简便。而Cn3D主要的特点是能够将两个蛋白放在一起直观地进行三维结构上的比较，如下图中是将两种核酸外切酶的三维结构通过VAST对准得到的结构比较图：同样，Cn3D在结构比较方面也能利用其内嵌的Blast搜索引擎直接访问Genbank找到具有局部相性的结构数据，并在三维中显示出二者具有相性的结构区域。

Spdbv 即Swiss-PdbViewer，

是一个界面非常友好的应用程序，使用起来比RASMOL方便，用来同时分析几个蛋白PDB文件。可以将几个蛋白叠加起来用来分析结构类性，比较活性位点或其它有关位点。通过菜单操作与直观的图形，可以很容易获得氢键、角度、原子距离、氨基酸突变等数据。该软件与Swiss-Model服务器（蛋白立体结构构建服务器）紧密关联，可以从软件直接连到Swiss-Model服务器进行理论蛋白立体结构构建。而且，该软件可以调用POV-Ray软件（见上）生成质量非常高的蛋白图像。

Molmol 主要用来进行各种分子文件的转换，支持30种主要分子式，也可以用来进行3维分子的简单显示。可将PDB式输出为POV式后，用POV-RAY进行渲染，生成非常漂亮的三维图形。演示版只支持样板文件与原子数小于20的分子文件式的转换。不知是否有取巧的办法。

十、生物显微图像分析

Scion Image

SigmaScan Pro 5.0

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