mapxtreme在vs里怎么用_mapxtreme_mapxtreme最新版(12)

Array Designer 2.00

DNA微矩阵（microarray）软件，批量设计DNA和寡核苷酸引物工具

二、RNA二级结构。

RNA Structure 3.5

RNA Sturcture 根据最小自由能原理，将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。mapxtreme提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力，使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。RNA文库（RNA Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。

基本配置：Windows95,Windows98或WindowsNT。Pentium以上芯片，32兆内存。

RNAdraw

是一个进行RNA二级结构计算的软件。 1. 它 是Windows下的多文档窗口 (multipledocument intece) 软件，允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能：打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退出程序。2. RNAdraw中一个非常非常重要的特征是鼠标右键菜单打开的菜单显示对鼠标当前所指向的对象/窗口可以使用的功能列表。3. RNA文库（RNA Library）用一种容易操作的方式来组织你所有的RNA数据文件。

loopDloop 2.07b

Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JA虚拟机。

Circles 0.1.0

Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JA虚拟机。

三、序列综合分析

Vector NTI Suite 8.0

不喜欢装备各种性强的软件，而希望用一个综合性的软件代替的同志可以选择本软件。本阶段的大部分功能它都有。该软件具体特有良好的管理（增加、修改、查找），对要操作的数据放在一个界面相同的中统一管理。软件中的大部分分析可以通过在中进行选定（数据）->分析->结果（显示、保存和入库）三步完成。在分析主界面，软件可以对核酸蛋白分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析和操作，生成重组分子策略和实验方法，进行限制酶片段的虚拟电泳，新建输入各种式的分子数据、加以注释，输出高质量的图像。Vector NTI Suite还有以下独立的分析程序，完成相关分析。这些独立的程序，可以通过选定->分析->结果三步调用。

l 3DMol－显示PDB式分子的三维结构

l Align X－序列相性比较

l Align Xblocks－序列局部完全相同比较

l ContigExpress－将小片段拼装成长序列

l GCGConverter－GCG式文件转换成NTI的式

l PubMed/Entrez Search－搜索PubMed、PDB、GenBank

l Back Translation－核酸->蛋白->核酸反向翻译的工具

l Tools Manager－连接其他程序和网络连接的界面。分成Align、Analyze、Assemble、Tools四部分。

DNAStar5.03 即著名的Lasergene Suite，由EditSeq MegAlign、GeneQuest MapDraw PrimerSelect Protean SeqMan II七个模块组成，该软件的MegAlign模块，可以对多达64000的片段进行拼装。整个拼装过程即时显示，并提示可能的完成时间。拼装结果采用序列、策略等方式显示。DNAstar是哈佛大学医学院是使用的序列分析软件，可见其功能强大。

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