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电脑杂谈  发布时间:2017-01-22 09:22:38  来源:网络整理

TMAP:提供预测蛋白跨膜片段的服务

21.RNA ysis

Pattern Search and Discovery:巴斯德研究所提供的常用RNA分析工具

DNA sequence ysis:巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具

Search Genes and Coding Regions:巴斯德研究所提供的常用DNA分析工具

Oligonucleotide Calculator:巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具

解链温度计算器:JA语言写的寡核苷酸计算器,给出核酸序列,计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。可以下载后使用,当小计算器

BCMgene-finder:核酸序列查找服务器,提交核酸序列,选择相应的,进行序列查找

22.引物设计

The Primer Generator:引物设计程序

Prime3:比较有名的引物设计程序

Sequin:GenBank,EMBL,DD查询软件

MiniViewer:数图阅览器

Compresslt:JBG(NLC)”JPG转换功能软件

Refs:参考文献管理软件

Scholars Aid:文献参考资料等日常资料的整理软件

paperworks:免费的参考文献管理软件

KD:知识仓库建库管理系统

15.基因芯片

AMADA:用来组织、研究、显示、分析微数组(Microarray)数据软件

ScanAlyze:进行微矩阵荧光图像分析软件

Cluster:对大量微矩阵数据组进行分析处理的软件

TreeView:用图形来显示Cluster软件分析的结果软件

AMAD:微数组

ArrayMakerv:Stanford大学Brown实验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档

J-Express:分析微矩阵(Mic

一、基因芯片:

1、基因芯片综合分析软件。

ArrayVision 7.0 医学教育网

一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。

Arraypro 4.0

Media Cybernetics公司的产品,该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。

J-express

挪威Bergen大学编写,是一个用JA语言写的应用程序,界面清晰漂亮,用来分析微矩阵(microarray)实验获得的基因表达数据,需要下载安装JA运行环境JRE1.2后(5.1M)后,才能运行。 医学教育网

2、 基因芯片阅读图像分析软件

ScanAlyze 2.44

,斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件,进行微矩阵荧光图像分析,包括定义栅与像素点分析。输出为分隔的文本式,可很容易地转化为任何。

Cluster

斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇(Cluster)分析与其它各种处理的软件。

SAM

Significance Analysis of Microarrays 的缩写,微矩阵显著性分析软件,EXCEL软件的插件,由Stanford大学编制。

4.基因芯片聚类图形显示

TreeView 1.5

斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。mapxtreme

FreeView

是基于JA语言的系统树生成软件,接收Cluster生成的数据,比Treeview增强了某些功能。

5.基因芯片引物设计


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    • 完颜雍
      完颜雍

      最爱的女神和最爱的男神配戏啦

    • 张婉琪
      张婉琪

      出来混迟早要还的

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