TMAP:提供预测蛋白跨膜片段的服务
21.RNA ysis
Pattern Search and Discovery:巴斯德研究所提供的常用RNA分析工具
DNA sequence ysis:巴斯德研究所提供的常用特征序列查询工具
Search Genes and Coding Regions:巴斯德研究所提供的常用DNA分析工具
Oligonucleotide Calculator:巴斯德研究所提供的基因与编码区查找工具
解链温度计算器:JA语言写的寡核苷酸计算器,给出核酸序列,计算GC百分比、解链温度、长度、分子量。可以下载后使用,当小计算器
BCMgene-finder:核酸序列查找服务器,提交核酸序列,选择相应的,进行序列查找
22.引物设计
The Primer Generator:引物设计程序
Prime3:比较有名的引物设计程序
Sequin:GenBank,EMBL,DD查询软件
MiniViewer:数图阅览器
Compresslt:JBG(NLC)”JPG转换功能软件
Refs:参考文献管理软件
Scholars Aid:文献参考资料等日常资料的整理软件
paperworks:免费的参考文献管理软件
KD:知识仓库建库管理系统
15.基因芯片
AMADA:用来组织、研究、显示、分析微数组(Microarray)数据软件
ScanAlyze:进行微矩阵荧光图像分析软件
Cluster:对大量微矩阵数据组进行分析处理的软件
TreeView:用图形来显示Cluster软件分析的结果软件
AMAD:微数组
ArrayMakerv:Stanford大学Brown实验室提供的基因芯片研究全套设备相配套的软件与文档
J-Express:分析微矩阵(Mic
一、基因芯片:
1、基因芯片综合分析软件。
ArrayVision 7.0 医学教育网
一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。
Arraypro 4.0
Media Cybernetics公司的产品,该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。
J-express
挪威Bergen大学编写,是一个用JA语言写的应用程序,界面清晰漂亮,用来分析微矩阵(microarray)实验获得的基因表达数据,需要下载安装JA运行环境JRE1.2后(5.1M)后,才能运行。 医学教育网
2、 基因芯片阅读图像分析软件
ScanAlyze 2.44
,斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件,进行微矩阵荧光图像分析,包括定义栅与像素点分析。输出为分隔的文本式,可很容易地转化为任何。
Cluster
斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇(Cluster)分析与其它各种处理的软件。
SAM
Significance Analysis of Microarrays 的缩写,微矩阵显著性分析软件,EXCEL软件的插件,由Stanford大学编制。
4.基因芯片聚类图形显示
TreeView 1.5
斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。mapxtreme
FreeView
是基于JA语言的系统树生成软件,接收Cluster生成的数据,比Treeview增强了某些功能。
5.基因芯片引物设计
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出来混迟早要还的
最爱的女神和最爱的男神配戏啦