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surfer_surfer12怎么使用_surfer软件(3)

电脑杂谈  发布时间:2016-12-31 20:01:43  来源:网络整理

这样结果就存放在g3v1.lh文件夹中,在这个文件夹中,还会生成7个子文件夹,每个文件夹对一个 统计比较 ,里面最重要的文件时一个叫做sig.mgz的文件

四、数据结果的整理和报告

当统计分析完后,需要对数据进行查看和整理,到底显著没有啊。首先肉眼看一下吧,看一下AA与AB有没有差异,p<0.01:

tksurfer fsaverage lh inflated -annot aparc.annot -fthresh 2 -overlay \g3v1.lh/C1/sig.mgh

如果有激活,下一步就是进行校正,这里就做Clusterwise Correction。

mri_glmfit-sim --glmdir g3v1.lh/C1 --sim mc-z 5000 4 mc-z.abs --sim-sig \abs --overwrite

这里用的Monte Carlo检验, 5000次, p<0.0001, Z进行绝对值比较,这样可以看双侧了,如果只想看AA>AB,那么就用“mc-z.pos”和 “--sim-sig pos”。overwright就是要把原始数据覆盖,生成一个新的CSD文件,放在C1文件夹中。这是一个文本文件。这一步需要几个小时的时间,这一步完成后,查看校正后的结果:

tksurfer fsaverage lh inflated -annot g3v1.lh/C1/mc-\z.abs4.sig.ocn.annot -fthresh 2 -curv -gray

或者

tksurfer fsaverage lh inflated -annot g3v1.lh/C1/mc-\z.abs4.sig.ocn.annot -fthresh 2 -overlay g3v1.lh/C1/mc-\z.abs4.sig.cluster.mgh

这就是最后的结果。


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